Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smpd1Q04519 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpd1Q04519 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms