Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CkbQ04447 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CkbQ04447 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CkbQ04447 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms