Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms