Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GscQ02591 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GscQ02591 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GscQ02591 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GscQ02591 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GscQ02591 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GscQ02591 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GscQ02591 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GscQ02591 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GscQ02591 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GscQ02591 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GscQ02591 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GscQ02591 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GscQ02591 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GscQ02591 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GscQ02591 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GscQ02591 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GscQ02591 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GscQ02591 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GscQ02591 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GscQ02591 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GscQ02591 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GscQ02591 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GscQ02591 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GscQ02591 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GscQ02591 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GscQ02591 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GscQ02591 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GscQ02591 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GscQ02591 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GscQ02591 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GscQ02591 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GscQ02591 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GscQ02591 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GscQ02591 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GscQ02591 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GscQ02591 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GscQ02591 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GscQ02591 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms