Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd1Q02242 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms