Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ascl1Q02067 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms