Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RykQ01887 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RykQ01887 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RykQ01887 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RykQ01887 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RykQ01887 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RykQ01887 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RykQ01887 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RykQ01887 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RykQ01887 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RykQ01887 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RykQ01887 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RykQ01887 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RykQ01887 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RykQ01887 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RykQ01887 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RykQ01887 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RykQ01887 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RykQ01887 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RykQ01887 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RykQ01887 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RykQ01887 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RykQ01887 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RykQ01887 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RykQ01887 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RykQ01887 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RykQ01887 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RykQ01887 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RykQ01887 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RykQ01887 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RykQ01887 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RykQ01887 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RykQ01887 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms