Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1cQ01815 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms