Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Gja5Q01231 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gja5Q01231 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja5Q01231 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja5Q01231 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja5Q01231 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja5Q01231 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja5Q01231 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja5Q01231 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja5Q01231 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja5Q01231 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja5Q01231 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja5Q01231 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms