Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde1bQ01065 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms