Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PrcdQ00LT2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms