Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms