Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms