Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf7Q00417 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms