Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax8Q00288 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pax8Q00288 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pax8Q00288 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pax8Q00288 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pax8Q00288 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pax8Q00288 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pax8Q00288 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pax8Q00288 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pax8Q00288 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pax8Q00288 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pax8Q00288 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pax8Q00288 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms