Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gbp10Q000W5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbp10Q000W5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms