Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gfra1P97785 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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