Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smyd1P97443 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd1P97443 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms