Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nbr1P97432 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms