Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhodP97348 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhodP97348 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RhodP97348 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RhodP97348 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RhodP97348 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RhodP97348 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RhodP97348 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhodP97348 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhodP97348 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RhodP97348 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms