Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-3P97334 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-3P97334 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms