Protein–RNA interactions for Protein: P97329

Kif20a, Kinesin-like protein KIF20A, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif20aP97329 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif20aP97329 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif20aP97329 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif20aP97329 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Kif20aP97329 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif20aP97329 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif20aP97329 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif20aP97329 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif20aP97329 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif20aP97329 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kif20aP97329 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif20aP97329 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kif20aP97329 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif20aP97329 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kif20aP97329 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kif20aP97329 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif20aP97329 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kif20aP97329 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif20aP97329 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif20aP97329 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif20aP97329 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif20aP97329 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Kif20aP97329 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif20aP97329 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif20aP97329 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif20aP97329 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif20aP97329 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif20aP97329 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif20aP97329 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif20aP97329 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif20aP97329 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kif20aP97329 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif20aP97329 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif20aP97329 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif20aP97329 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif20aP97329 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kif20aP97329 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif20aP97329 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif20aP97329 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif20aP97329 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif20aP97329 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif20aP97329 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif20aP97329 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif20aP97329 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kif20aP97329 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif20aP97329 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms