Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vgll3P85442 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms