Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf1P84078 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf1P84078 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf1P84078 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms