Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms