Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Otx1P80205 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Otx1P80205 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms