Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp9xP70398 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9xP70398 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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