Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeboxP70368 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SeboxP70368 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms