Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smad1P70340 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad1P70340 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms