Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Plxna3P70208 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Plxna3P70208 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plxna3P70208 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plxna3P70208 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plxna3P70208 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plxna3P70208 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plxna3P70208 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plxna3P70208 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms