Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrig1P70193 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrig1P70193 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrig1P70193 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrig1P70193 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrig1P70193 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrig1P70193 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrig1P70193 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrig1P70193 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrig1P70193 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrig1P70193 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrig1P70193 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrig1P70193 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrig1P70193 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrig1P70193 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms