Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpnP63163 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpnP63163 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms