Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Crabp1P62965 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms