Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps3P62908 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps3P62908 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps3P62908 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms