Protein–RNA interactions for Protein: P62852

Rps25, 40S ribosomal protein S25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps25P62852 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps25P62852 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps25P62852 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms