Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lsm3P62311 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms