Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Copz1P61924 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Copz1P61924 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms