Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga11P61622 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms