Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg6P61406 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg6P61406 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg6P61406 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg6P61406 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg6P61406 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg6P61406 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms