Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl27P61358 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl27P61358 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms