Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psme3P61290 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms