Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PlnP61014 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PlnP61014 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PlnP61014 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PlnP61014 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PlnP61014 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PlnP61014 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PlnP61014 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PlnP61014 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PlnP61014 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PlnP61014 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PlnP61014 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PlnP61014 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms