Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap25P60879 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap25P60879 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap25P60879 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap25P60879 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap25P60879 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap25P60879 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snap25P60879 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Snap25P60879 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snap25P60879 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snap25P60879 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms