Protein–RNA interactions for Protein: P60843

Eif4a1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4a1P60843 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Eif4a1P60843 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms