Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp4P59240 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp4P59240 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms