Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Csrnp3P59055 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csrnp3P59055 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms