Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Paxbp1P58501 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms