Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strn4P58404 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strn4P58404 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Strn4P58404 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strn4P58404 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms