Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atp5eP56382 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms