Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sh3bp1P55194 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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